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Human Gene Set: GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_VS
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| Standard name | GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_IKAROS_KO_UP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Systematic name | M7043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Brief description | Genes up-regulated in IKZF1 [GeneID=10320] knockout: megakaryo-erythrocyte progenitors versus granulo-monocyte progenitors. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Full description or abstract | Regulation of lineage potential and transcriptional priming by Ikaros. New insight is provided into a bivalent regulation of lineage priming in the HSC and its lympho-myeloid restricted progeny the LMPP by the lymphoid lineage-determining factor Ikaros Whereas Ikaros is responsible for the activation of a cascade of lymphoid expression programs and for the establishment of lymphoid potential from the HSC to the LMPP it is also responsible for the repression of stem cell and erythroid genetic programs that are incompatible with further lineage restrictions emanating from the LMPP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Collection | C7: Immunologic Signature IMMUNESIGDB: ImmuneSigDB |
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| Source publication | Pubmed 19345118 Authors: Ng SY,Yoshida T,Zhang J,Georgopoulos K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Exact source | GSE15330_2839_200_UP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Related gene sets |
(show 39 additional gene sets from the source publication)
GSE15330_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_VS_PRO_BCELL_DN GSE15330_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_VS_PRO_BCELL_UP GSE15330_HSC_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_DN GSE15330_HSC_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_IKAROS_KO_DN GSE15330_HSC_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_IKAROS_KO_UP GSE15330_HSC_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_UP GSE15330_HSC_VS_LYMPHOID_PRIMED_MULTIPOTENT_PROGENITOR_DN GSE15330_HSC_VS_LYMPHOID_PRIMED_MULTIPOTENT_PROGENITOR_IKAROS_KO_DN GSE15330_HSC_VS_LYMPHOID_PRIMED_MULTIPOTENT_PROGENITOR_IKAROS_KO_UP GSE15330_HSC_VS_LYMPHOID_PRIMED_MULTIPOTENT_PROGENITOR_UP GSE15330_HSC_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_DN GSE15330_HSC_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_IKAROS_KO_DN GSE15330_HSC_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_IKAROS_KO_UP GSE15330_HSC_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_UP GSE15330_HSC_VS_PRO_BCELL_DN GSE15330_HSC_VS_PRO_BCELL_UP GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_DN GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_IKAROS_KO_DN GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_IKAROS_KO_UP GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_UP GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_DN GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_IKAROS_KO_DN GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_IKAROS_KO_UP GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_UP GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_PRO_BCELL_DN GSE15330_LYMPHOID_MULTIPOTENT_VS_PRO_BCELL_UP GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_VS_PRO_BCELL_DN GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_VS_PRO_BCELL_UP GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_DN GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_IKAROS_KO_DN GSE15330_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_VS_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_UP GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_DN GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_GRANULOCYTE_MONOCYTE_PROGENITOR_UP GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_HSC_DN GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_HSC_UP GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_LYMPHOID_MULTIPOTENT_PROGENITOR_DN GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_LYMPHOID_MULTIPOTENT_PROGENITOR_UP GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_DN GSE15330_WT_VS_IKAROS_KO_MEGAKARYOCYTE_ERYTHROID_PROGENITOR_UP (show 65 gene sets from the same authors) AGUIRRE_PANCREATIC_CANCER_COPY_NUMBER_DN AGUIRRE_PANCREATIC_CANCER_COPY_NUMBER_UP ELLWOOD_MYC_TARGETS_DN ELLWOOD_MYC_TARGETS_UP FLECHNER_BIOPSY_KIDNEY_TRANSPLANT_OK_VS_DONOR_DN FLECHNER_BIOPSY_KIDNEY_TRANSPLANT_OK_VS_DONOR_UP FLECHNER_BIOPSY_KIDNEY_TRANSPLANT_REJECTED_VS_OK_DN FLECHNER_BIOPSY_KIDNEY_TRANSPLANT_REJECTED_VS_OK_UP FLECHNER_PBL_KIDNEY_TRANSPLANT_OK_VS_DONOR_DN FLECHNER_PBL_KIDNEY_TRANSPLANT_OK_VS_DONOR_UP FLECHNER_PBL_KIDNEY_TRANSPLANT_REJECTED_VS_OK_DN FLECHNER_PBL_KIDNEY_TRANSPLANT_REJECTED_VS_OK_UP GSE33513_TCF7_KO_VS_HET_EARLY_THYMIC_PROGENITOR_DN GSE33513_TCF7_KO_VS_HET_EARLY_THYMIC_PROGENITOR_UP HONMA_DOCETAXEL_RESISTANCE HSIAO_HOUSEKEEPING_GENES HSIAO_LIVER_SPECIFIC_GENES KOYAMA_SEMA3B_TARGETS_DN KOYAMA_SEMA3B_TARGETS_UP NAKAYAMA_SOFT_TISSUE_TUMORS_PCA1_DN NAKAYAMA_SOFT_TISSUE_TUMORS_PCA1_UP NAKAYAMA_SOFT_TISSUE_TUMORS_PCA2_DN NAKAYAMA_SOFT_TISSUE_TUMORS_PCA2_UP PODAR_RESPONSE_TO_ADAPHOSTIN_DN PODAR_RESPONSE_TO_ADAPHOSTIN_UP WANG_LSD1_TARGETS_DN WANG_LSD1_TARGETS_UP XU_RESPONSE_TO_TRETINOIN_AND_NSC682994_DN XU_RESPONSE_TO_TRETINOIN_AND_NSC682994_UP XU_RESPONSE_TO_TRETINOIN_DN XU_RESPONSE_TO_TRETINOIN_UP YAP1_DN YAP1_UP ZHANG_TARGETS_OF_EWSR1_FLI1_FUSION ZHONG_PFC_C1_ASTROCYTE ZHONG_PFC_C1_DLX5_POS_INTERNEURON ZHONG_PFC_C1_MICROGLIA ZHONG_PFC_C1_NEUROD1_POS_EXCITATORY_NEURON ZHONG_PFC_C1_OPC ZHONG_PFC_C2_ASCL1_POS_ASTROCYTE ZHONG_PFC_C2_SOX5_BCL11B_POS_EXCITATORY_NEURON ZHONG_PFC_C2_THY1_POS_OPC ZHONG_PFC_C2_UNKNOWN_NPC ZHONG_PFC_C3_ASTROCYTE ZHONG_PFC_C3_HOPX_POS_OPC ZHONG_PFC_C3_MICROGLIA ZHONG_PFC_C3_PROX1_CCK_POS_INTERNEURON ZHONG_PFC_C3_UNKNOWN_INP ZHONG_PFC_C4_PTGDS_POS_OPC ZHONG_PFC_C4_UNKNOWN_INP ZHONG_PFC_C5_BCL11B_CALB2_POS_INP ZHONG_PFC_C6_DLX5_GAD1_GAD2_POS_INTERNEURON ZHONG_PFC_C6_PLXNA4_POS_EXCITATORY_NEURON ZHONG_PFC_C7_ORG_UNDERGOING_NEURONAL_DIFFERENTIATION ZHONG_PFC_C7_SST_LHX6_POS_PUTATIVE_MIGRATING_INTERNEURON ZHONG_PFC_C8_ORG_PROLIFERATING ZHONG_PFC_C8_UNKNOWN_NEUROD2_POS_INTERNEURON ZHONG_PFC_C9_ORG_OTHER ZHONG_PFC_HES1_POS_C1_NPC ZHONG_PFC_MAJOR_TYPES_ASTROCYTES ZHONG_PFC_MAJOR_TYPES_EXCITATORY_NEURON ZHONG_PFC_MAJOR_TYPES_INTERNEURON ZHONG_PFC_MAJOR_TYPES_MICROGLIA ZHONG_PFC_MAJOR_TYPES_NPCS ZHONG_PFC_MAJOR_TYPES_OPC |
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| Source species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Contributed by | Jernej Godec (Dana-Farber Cancer Institute) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source platform or identifier namespace |
HUMAN_GENE_SYMBOL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dataset references |
(show 1 datasets)
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| Download gene set | format: grp | gmt | xml | json | TSV metadata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compute overlaps ? |
(show collections to investigate for overlap with this gene set)
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| Compendia expression profiles ? |
NG-CHM interactive heatmaps (Please note that clustering takes a few seconds) Legacy heatmaps (PNG) |
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| Advanced query | Further investigate these 200 genes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene families ? | Categorize these 200 genes by gene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Show members |
(show 200 source identifiers mapped to 200 genes)
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| Version history | 7.3: Moved to ImmuneSigDB sub-collection. |
See MSigDB license terms here. Please note that certain gene sets have special access terms.
